Fue fundada en 1818 por Federico Guillermo III. Entre sus profesores se contaron personalidades ilustres como Barthold Nibbuhr, A. W. von Schlegel, C. F. Nasse y Jorge Hermes. Sólo Berlín la aventajaba en importancia (v. Universidad de Berlín). Tenía Facultades de Teología, Derecho y Economía, Filosofía, Medicina, Ciencias Naturales y Matemáticas y Economía Agrícola (ésta incorporada en 1934). Bajo el régimen nacionalista el número de matrículas descendió de 5500 en 1930 a 2500 en 1939. Sus edificios, originariamente residencia arzobispal, sufrieron en 1944 las consecuencias de los bombardeos aéreos. En 1945 inicióse la reconstrucción y ya en el invierno de 1945-46 se abría de nuevo la escuela.